Energie de cohésion dans des systèmes moléculaires cristallins

Relation structure – fonctionnalité des molécules photosensitives encapsulées dans des matrices poreuses

stages programmation scientifique, développement de logiciel

Ces stages sont destinés à des étudiants de formation :
Informatique, Mathématiques Appliquées, Physique, Biophysique ou Chimie Physique.
Une bonne connaissance de la langue anglaise est indispensable.

La cristallographie peut être vue comme une méthode d’imagerie très puissante qui permet de voir au cœur de la matière, et ce jusqu’à la déformation de la distribution électronique autour des atomes. Ainsi, il est possible de déterminer les structures moléculaires avec un très haut niveau de détails et d’en déduire des informations importantes sur les propriétés physiques qui sont la clef de la réactivité chimique de ces molécules (potentiel électrostatique, charges atomiques….).

Pour obtenir ces informations sur des composés organiques ou des macromolécules biologiques (protéines, ADN), le logiciel MoPro (MOlecular PROperties) a été spécialement développé dans l'equipe EMQC du laboratoire. Nous proposons des stages dans le cadre du développement du logiciel, pour des étudiants désirant programmer et parfaire leurs connaissances en génie logiciel ou en modélisation moléculaire. La partie calcul scientifique du logiciel est écrit en langage fortran 90/95 tandis que l'interface graphique est en en JAVA et C++.

Cette figure montre, dans le cas d'une liaison peptidique isolée, les électrons impliqués dans les liaisons covalentes ainsi que les doublets non liants de l’atome d’oxygène de la chaîne protéique. Ces informations sont très utiles pour modéliser les forces électrostatiques et la reconnaissance moléculaire

Stage C++

L'interface graphique comporte notamment un module interactif de visualisation tridimensionnelle des structures moléculaires. De nouvelles fonctionalités seront programmées en langage C++. contact :

Stage Java

Amélioration de l'interface graphique écrit en JAVA. L'étudiant devra montrer une maîtrise du langage JAVA, et être capable de s'intégrer dans un projet en cours de réalisation.

Stage fortran

Implémentation de nouveaux algorithmes de calcul scientifique en fortran.

Contacts :

Laboratoire de Cristallographie, Résonance Magnétique et Modélisations
CNRS - Nancy Université
Faculté des Sciences et Technologies. Entrée 3B, 3e étage. Tel: 03.83.68.48.99
Bd des Aiguillettes. Vandoeuvre les Nancy
http://www.crm2.uhp-nancy.fr/crm2/fr/labo/equipes/emqc/